После долгих лет тренировок под руководством мудрого Сплинтера, Черепашки-ниндзя, каждый со своим уникальным набором навыков и черт характера, выходят из своей укромной канализационной обители на улицы Нью-Йорка. Их первая встреча с миром начинается с ночного патрулирования, когда они слышат крики о помощи. Выйдя на свет, они впервые сталкиваются с бандой уличных грабителей. Быстрая и эффективная работа в команде позволяет черепашкам одержать победу. Однако, это всего лишь начало их приключений. Леонардо, лидер команды и мастер меча, всегда готов взять на себя ответственность за группу и внимательно следит за порядком в их небольшом мире. Донателло, технический гений, с легкостью собирает из подручных средств различные гаджеты, которые помогают им в борьбе с преступностью.
Рафаэль, обладающий непримиримым характером и окутанный аурой силы, часто вступает в конфликты, но именно он защищает братьев от опасностей, даже ценой собственного спокойствия. Микеланджело же, вечный шутник, привносит в команду легкость и юмор, что помогает справляться с напряженными ситуациями. Основным врагом Черепашек становится загадочный клан Нога — тайная преступная организация, возглавляемая коварным и опытным мастером Шреддером. Этот самурай и бизнесмен в одном лице не остановится ни перед чем, чтобы захватить контроль над городом. Шреддер давно имеет личные счеты со Сплинтером и видит в черепашках-недочеловеках угрозу своим планам. При помощи различных наемников и мутантов, созданных с использованием мутагена, Шреддер раз за разом старается победить их. На пути к своему главному противнику Черепашки сталкиваются с множеством опасностей и загадок. Одним из таких испытаний становится встреча с загадочной Ороку Караи — таинственной воительницей, связанной с кланом Нога. Караи, обладая навыками ниндзя, способна предоставить серьезный вызов.
Однако вскоре выясняется, что её мотивы не так однозначны, и Черепашкам предстоит решить, видят ли они в ней друга или врага. Одним из поворотных моментов в судьбе Черепашек становится знакомство с Эйприл О'Нил — юной репортершей, которая случайно раскрывает их тайну. Она становится их верным союзником и другом, помогая в самых сложных ситуациях. Благодаря её информации Черепашки часто оказываются на шаг впереди своих врагов и узнают о планах Шреддера. В моменты передышки команда наслаждается повседневной жизнью, основываясь на маленьких радостях — от пиццы с самыми невероятными начинками до дружеских спаррингов в канализации. Однако, несмотря на временами легкомысленный подход к жизни, Черепашки всегда готовы к новым испытаниям. Вместе они не только сражаются с преступностью, но и учатся принимать мир таким, какой он есть, подтверждая своё кредо: быть героями не только на улице, но и в сердце каждого из них.
