Майкл Скофилд — талантливый инженер-строитель, который оказывается в центре головокружительного приключения. Его брат Линкольн Барроуз осужден за преступление, которого, как убежден Майкл, он не совершал. Единственный способ помочь брату избежать несправедливой казни — проникнуть в тюрьму "Фокс Ривер" и организовать дерзкий побег. Парадоксально, но Майкл осознанно совершает преступление, чтобы получить нужный ему приговор и оказаться за решеткой рядом с Линкольном. Тюрьма "Фокс Ривер" — не просто тюрьма: это сложное инженерное сооружение, которое Майкл изучил до мельчайших деталей, так как сам участвовал в его проектировании. Главный козырь Майкла — детальный план побега, который он набил на своем теле в виде тщательно замаскированной татуировки. В ее узорах скрыты схемы, коды и важные подсказки, которые помогут ему и брату выбраться на свободу. Попав в тюрьму, Майкл быстро завоевывает репутацию среди заключенных и тюремного персонала. Однако на пути к реализации своего плана он сталкивается с множеством препятствий. Ему приходится лавировать в сложной сети интриг и альянсов, находить общий язык с другими заключенными, от которых многое зависит. Среди них — Сукре, надежный друг и союзник, Абруцци, опасный мафиози, и загадочный Ти-Бэг, который может стать как союзником, так и смертельной угрозой.
План побега осложняется тем, что Майклу приходится балансировать на грани раcкрытия. Чутье и интуиция начальника тюрьмы Беллика, который не доверяет новому заключенному, постоянно ставят Майкла в рискованные ситуации. Тем временем, на воле адвокат Вероника Донован, близкая подруга братьев, проводит собственное расследование, пытаясь найти доказательства невиновности Линкольна и вскрыть заговор, в который втянуто правительство и могущественные корпорации. Каждый эпизод — это новая загадка и испытание. Надвигающиеся сроки казни подстегивают Майкла, заставляя его действовать все решительнее и осторожнее. Тщательно проработанный план начинает рушиться под натиском неожиданных проблем и взаимных ссор среди заключенных, что ведет к непредсказуемым последствиям. Секунды до побега уносятся бесконечной чередой с напряжением и драмой. Майкл должен довериться своим инстинктам и людям вокруг, надеясь, что расчет и подготовка не подведут. Вопрос свободы и жизни его брата полностью зависит от того, сможет ли он обыграть систему, которую сам же и помог построить.