История начинается в небольшом городке, где зрителям представляется главный герой — Шон Мёрфи, молодой врач, страдающий аутизмом и синдромом саванта. Он переезжает в крупный мегаполис, чтобы начать работу в престижной больнице в хирургическом отделении. Его путь не прост: многие коллеги скептически относятся к его способностям, считая, что его диагноз будет мешать взаимодействию с пациентами и коллегами. Однако, благодаря поддержке доктора Аарона Гласмана, давнего наставника Шона, герой получает шанс доказать всем свою уникальную ценность. С первых же дней работы Мёрфи сталкивается с множеством профессиональных испытаний. Его интуиция и феноменальная память позволяют ему ставить точные диагнозы, которые иногда кажутся невозможными для других.
В одной из серий Шон находит редкое заболевание у ребёнка, когда все остальные врачи уже сдались, не сумев выяснить причину ухудшающего состояния пациента. Это вызывает удивление и восхищение у некоторых его коллег, хотя кто-то продолжает сомневаться в его методах. Одновременно с профессиональными вызовами, сюжет показывает и личные сложности Шона. Он старается найти общий язык с коллегами и пациентами, но сталкивается с непониманием и социальными барьерами, связанными со своими особенностями. Герой искренне пытается наладить отношения с соседями по квартире и завести друзей среди коллег, постепенно находя ключ к ним через искренность и профессиональные успехи. Ещё одна важная сюжетная линия — прошлое Шона, его сложные отношения с отцом и трагическая потеря брата, которые сделали его таким, какой он есть. Эти воспоминания периодически всплывают, оказывая влияние на его текущую жизнь и решения. В одной из серий показаны воспоминания из детства, когда Шон с братом прятались от жестокости отца, что позволяет глубже понимать мотивы его нынешних поступков.
Особую роль в сериале играют его взаимоотношения с доктором Клэр Браун, которая становится одной из немногих коллег, искренне поддерживающих Мёрфи. Показаны их совместные сложности на работе, где они учатся доверять друг другу и работать в команде. Клэр видит в Шоне не просто талантливого врача, но и человека, который, несмотря на свои особенности, способен на сопереживание и сочувствие. По мере развития сюжета, Шон не только завоёвывает уважение в медицинском сообществе, но и совершает личностный рост, учась справляться с эмоциональными и социальными вызовами. Каждая серия предлагает зрителям новые медицинские загадки, которые раскрываются благодаря уникальному таланту и упорству главного героя. Шон Мёрфи продолжает демонстрировать, что вера в себя и поддержку окружающих может творить чудеса даже в самых сложных ситуациях.